Slovenčina English
homepageBreeders diaryPregnancy calendar
všetko o RR
štandard
RR magazín
publikácie
inzercia šteniat
výstavy
archív
Vstup do databáz
Vstup do databáz
chovateľstvo
krycí psi
chovné suky
šampióni
www links
osobné stránky
chovatelia
užitočné linky
RR v núdzi
RR Shop
 
 
kontakt
Rhodesian Ridgeback SK 20years
Späť
DNA profil a výber optimálneho chovného páru  
Autor: Monika Tušanová| Streda, 25.11.2015 | Téma: Chovateľstvo a genetika (1183 čítané)
 

Nie je tomu ani tak dávno, keď sme plánovali a skladali rodokmene chovného páru, rátali počet spoločných predkov, ich vzdialenosť medzi sebou a zložitými výpočtami prerátavali mieru príbuzenstva. Niektorí pomocou prísnych matematických vzorcov (*IC a COR), iní sa zas spoliehali na svoj chovateľský cit a tzv. zdravý sedliacky rozum.

Snahou skladania rodokmeňov je vždy zachovať a upevniť dobré vlastnosti a nespájať tie zlé. Inými slovami minimalizovať riziko ochorení a genetických porúch a popri tom zachovať vlastnosti plemena a vylepšovať exteriér. Výsledkom má byť zdravý, funkčný a krásny ridgeback.

Dnes máme k dispozícií nielen genetické testy, ktoré nám priamo pomáhajú vyhnúť sa niektorým dedičným chorobám, ale aj ďalšiu pomôcku – genetický profil psa a výpočet diverzného koeficientu chovného páru. Tieto výpočty nám môžu o niečo presnejšie predpovedať genetické zdravie potomstva.

Avšak rovnako ako aj pri testoch platí, že ide o nástroj, ktorý nám môže byť dobrou pomôckou pri rozumnom plánovaní, ale nie vždy dobrým radcom. Náš pes sa neskladá iba z čísel a imaginárnych hodnôt, ktorými nakŕmime kalkulačku, stlačíme čarovný gombík a máme dokonalé šteniatka. K takému cieľu potrebujeme toho ešte omnoho viac.


Čo je to genetický profil psa?

Stanovenie genetického profilu znamená určiť súbor genetických znakov, ktoré sú pre daného jedince charakteristické a nezameniteľné (napr. ako odtlačok prstu). Podľa genetického profilu je možné jedinca jednoznačne identifikovať.


Ako ho vieme v praxi využiť?

Ak máme genetický profil psa, máme jeho celoživotnú identifikáciu, ktorú vieme využiť pri:
1) Preukázanie identity psa v prípade jeho straty, odcudzenia alebo nového čipovania po zlyhaní pôvodného mikročipu. Preukázanie identity je vyžadované pri uchovávaní mrazeného sperma.

2) Overenie rodičovstva v prípade pochybností, či daný jedinec je priamym predkom (potomkom) daného jedinca. Hľadajú sa spoločné znaky v ich DNA. Biologický rodič sa zhoduje s potomkom vždy z 50% v každej z sekvencii DNA.

3) Overenie "clear po rodičoch". Ak sú obaja rodičia testovaní na určitú dedičnú vlohu s výsledkom N/N (negative, clear) je automaticky aj potomok na túto vlohu “clear po rodičoch". Toto môže byť dokladované buď priamym testom potomka, alebo testom rodičovstva (šteňa je potomkom deklarovaných rodičov, ktorí nemajú onú genetickú chybu.)

4) Výber optimálneho chovného páru porovnaním variability genetických profilov potenciálnych rodičov.


Porovnanie genetických profilov - stanovenie diverzného koeficientu
- výber optimálneho chovného páru


zdroj: Genomia.cz
preložila Monika Tušanová


Diverzný koeficient je číslo, ktoré vyjadruje genetickú podobnosť daného chovného páru. Čím je číslo menšie, tým sú samec a samica geneticky rozdielnejší. Koeficient sa stanoví porovnaním ich DNA profilov.

Je žiadúce, aby bol chovný pár maximálne heterozygotný (rozdielny) v porovnávaných znakoch. Všeobecne platí, že čím viac vzájomne rozdielnych znakov jedinci nesú, tým menej sú si geneticky podobní.

Porovnanie genetických profilov chovných jedincov nám dáva príležitosť maximalizovať genetickú rozmanitosť (diverziu) v rámci plemena a zachovať pri tom požadované fyzické a psychické vlastnosti.

Porovnaním variability genetických profilov vybraných jedincov sa stanoví diverzný koeficient, na základe ktorého môže chovateľ vybrať geneticky najvhodnejší chovný pár.

Samozrejmosťou pritom musí byť, že optimálny chovný jedinec sa vyberá na základe viacero faktorov. Ako najdôležitejší je štandard plemena, zdravie, temperament, pracovné schopnosti, exteriér.

V dnešnej dobe má chovateľ na výber medzi špičkovými jedincami daného plemena z celého sveta. Ako sa správne rozhodnúť medzi dvoma či viacerými vybranými chovnými jedincami?

Práve porovnanie genetických profilov chovnej samice a niekoľko potenciálnych partnerov, alebo naopak chovného samca a niekoľko partneriek, nám môže uľahčiť správny výber. Pre ideálne párenie je vhodné vybrať geneticky najvariabilnejší pár, ktorý zachová čo najvyššiu genetickú rôznorodosť potomstva.

Vďaka špecializovanému šľachteniu jednotlivých psích rás došlo u viacero plemien k výraznému zníženiu genetickej variability (heterozygoti). Znížená genetická variabilita daného plemene často vedie k výskytu genetických chorôb a zníženiu počtu zdravých mláďat vo vrhu. Vo všeobecnosti platí, že s vyššou génovou rôznorodosťou v populácii plemena výrazne klesá riziko výskytu genetických chorôb. Preto sa v súčasnej dobe pri šľachtení kladie tak veľký dôraz na zachovanie či postupné zvyšovanie genetickej variability daného plemena.

Porovnanie genetických profilov potenciálneho chovného páru nám umožní výpočet tzv. diverzného koeficientu daného páru. Ideálny chovný pár má diverzný koeficient čo najnižší – taký pár produkuje s najvyššou pravdepodobnosťou geneticky najvariabilnejšie potomstvo.


Ako porovnať genetické profily psov?


Prehľad psieho DNA profilu a testovaných chromozómov

U psov je analyzovaných 22 markerov s vysokou vypovedajúcou hodnotou, lokalizovaných na mnoho kľúčových chromozómoch. Diverzný koeficient je vypočítavaný z 21 markerov. (Amelogenin nie je pre výpočet vypovedajúci, určuje iba pohlavie jedinca).
    Marker Chromozóm Marker Chromozóm
    INRA21 21 REN54P11 18
    AHT137 11 INU030 12
    REN169D0 14 Amelogenin X
    AHTh260 16 AHT121 13
    AHTk253 23 FH2054 12
    INU005 33 REN162C04 7
    REN169O18 29 AHTh171 6
    INU055 10 REN247M23 15
    FH2848 2 AHTH130 36
    AHTk211 26 REN105L03 11
    CXX279 22 REN64E19 34


Príklad výpočtu diverzného koeficientu pre psí pár

S = genetický profil suky, pre ktorú hľadám ideálneho partnera (aby chovný pár bol geneticky čo najviac variabilný, mal čo najnižší diverzný koeficient)
P1 = genetický profil prvého potenciálneho partnera
P2 = genetický profil druhého potenciálneho partnera

    Marker Hodnota (S) Hodnota (P1) Hodnota (P2)
    INRA21 97/99 97/99 97/97
    AHT137 133/133 133/149 137/149
    REN169D0 202/2016 210/212 202/216
    AHTh260 246/250 246/250 244/252
    AHTk253 286/286 286/286 288/290
    INU005 110/126 110/126 110/126
    REN169O18 160/160 162/162 160/166
    INU055 210/210 210/210 210/210
    FH2848 234/242 238/238 240/244
    AHTk211 89/97 89/95 89/89
    CXX279 120/128 118/124 120/126
    INU030 150/150 150/150 144/150
    Amelogenin X/X X/Y X/Y
    REN54P11 226/226 232/232 232/232
    AHT121 92/94 92/92 92/102
    FH2054 156/160 152/152 156/156
    REN162C04 202/204 202/204 204/204
    AHTh171 225/235 221/235 221/235
    REN247M23 268/268 268/268 268/270
    AHTH130 127/129 127/129 129/133
    REN105L03 231/235 235/235 235/235
    REN64E19 145/153 145/153 145/155

Výpočet diverzných koeficientov potenciálnych chovných psích párov:
(podľa kalkulačky diverzného koeficientu)

    Marker alt (S+P1) alt (S+P2)
    INRA21 0,5 0,5
    AHT137 0,5 0
    REN169D0 0 0,5
    AHTh260 0,5 0
    AHTk253 1 0
    INU005 0,5 0,5
    REN169O18 0 0,5
    INU055 1 1
    FH2848 0 0
    AHTk211 0,25 0,5
    CXX279 0 0,25
    INU030 1 0,5
    Amelogenin -- --
    REN54P11 0 0
    AHT121 0,5 0,25
    FH2054 0 0,5
    REN162C04 0,5 0,5
    AHTh171 0,5 0,25
    REN247M23 1 0,5
    AHTH130 0,5 0,25
    REN105L03 0,5 0,5
    REN64E19 0,5 0,25
    Diverzný koeficient 9,25 7,25

Tabuľka ukazuje jednotlivé diverzné koeficienty u 21 určených markerov profilu suky a dvoch potenciálnych partnerov.

Interpretácia výsledkov

Pokiaľ má suka s partnerom úplne iné hodnoty v danom markeri, diverzný koeficient je 0.

Hodnota diverzného koeficientu 0.25 znamená 25% pravdepodobnosť, že potomok bude v tomto markeri homozygotný.

Hodnota diverzného koeficientu 0.5 znamená 50% pravdepodobnosť, že potomok bude v tomto markeri homozygotný.

Pokiaľ je hodnota diverzného koeficientu 1, potomok bude 100% homozygotný v danom markeri.

Celkový diverzný koeficient je súčtom jednotlivých koeficientov 21 markerov. Maximálna hodnota je teda 21, minimálna 0. Čím je hodnota diverzného koeficientu nižšia, tým lepšie.

V uvedenom príklade by sme teda volili spomedzi dvoch potenciálnych partnerov partnera č. 2, ktorého celkový diverzný koeficient so sukou je 7.25, na rozdiel od partnera č. 1, u ktorého celkový diverzný koeficient so sukou je 9,25.

Diverzia v jednotlivých markeroch u psov je v rámci plemien rôzna, záleží na genetickom základne daného plemena.



Spracovala ©Monika Tušanová, 11/2015
použité zdroje: genomia.cz a vlastné chovateľské skúsenosti


*Inbreeding Coeficient a Coeficient of Relationship

 

Copyright ©www.rr.sk . Obsah stránok podlieha autorským právam.
Kopírovanie akejkoľvek jej časti len so súhlasom autora a majiteľa stránok.
Všetky práva vyhradené!

                     © 2005 © 2017 www.rr.sk
Rhodesian Ridgeback klub Slovakia
Heslo: 
Číslo:   
napísali o nás
záujem o členstvo
kontakt
plánované akcie
klubové dni
klubové súťaže
povahové testy
Návštevy
Online:21
štatistiky
RR-shop